Nghiên cứu này phân tích những khó khăn và thách thức trong quản lý chất lượng chương trình đào tạo theo cách tiếp cận AUN-QA tại các trường đại học tư thục ở Thành phố Hồ Chí Minh. Nghiên cứu sử dụng phương pháp hỗn hợp và thiết kế cắt ngang, khảo sát 146 cán bộ quản lý và giảng viên có thâm niên tại 4 trường trong số 17 trường đại học tư thục. Thang đo gồm 10 nhóm nội dung về cam kết lãnh đạo, đảm bảo chất lượng bên trong, giáo dục dựa trên chuẩn đầu ra (OBE), nguồn lực, minh chứng và dữ liệu, văn hóa chất lượng, PDCA, sự tham gia của các bên liên quan và các hạn chế đặc thù của trường tư thục; thang đo có độ nhất quán nội tại cao (Cronbach’s α = .95). Kết quả cho thấy những thách thức nổi bật nhất là xây dựng văn hóa chất lượng, duy trì cam kết lãnh đạo, bảo đảm nguồn lực, phát triển chương trình theo OBE và thu thập phản hồi của các bên liên quan. Hạn chế về nguồn lực được đề cập thường xuyên nhất trong các câu trả lời mở. Nghiên cứu cho thấy triển khai AUN-QA hiệu quả không chỉ phụ thuộc vào việc đáp ứng các tiêu chuẩn kiểm định mà còn cần các điều kiện thể chế và văn hóa chất lượng hỗ trợ cải tiến liên tục.